Descripción
Resumen:
Liderar el desarrollo, la optimización y el mantenimiento de pipelines computacionales para el análisis de datos de secuenciación de próxima generación (NGS) en apoyo de estudios clínicos y preclínicos.
Aspectos destacados:
1. Liderar el desarrollo de pipelines computacionales para el análisis de datos de secuenciación de próxima generación (NGS)
2. Colaborar en la integración de ensayos basados en secuenciación en flujos de trabajo
3. Diseñar e implementar herramientas bioinformáticas escalables
Para una organización de investigación por contrato (CRO) (Frontage Laboratories, Inc. – Deerfield Beach, FL): liderar el desarrollo, la optimización y el mantenimiento de pipelines computacionales para el análisis de datos de secuenciación de próxima generación (NGS) en apoyo de estudios clínicos y preclínicos; colaborar con equipos multidisciplinarios para integrar ensayos basados en secuenciación, incluidos el perfilado tumoral, el análisis de línea germinal y las aplicaciones de ADN libre en células, en flujos de trabajo rutinarios; diseñar e implementar herramientas bioinformáticas escalables y reproducibles utilizando R, Python y plataformas estándar de la industria; colaborar con científicos de laboratorio experimental para solucionar problemas y perfeccionar flujos de trabajo genómicos de alto rendimiento, garantizando un rendimiento robusto del ensayo en diversas matrices biológicas; apoyar la validación y despliegue de ensayos basados en NGS en entornos regulados de producción; proporcionar liderazgo científico y estratégico en el diseño de proyectos, la interpretación de datos y la documentación regulatoria para estudios patrocinados por clientes.
Requisitos:
Título de Maestría en Ciencias o título equivalente obtenido en el extranjero en Biología, Biología Computacional, Genómica o un campo relacionado.
3 años de experiencia en el puesto ofertado o 3 años de experiencia como Biólogo Computacional. La experiencia debe incluir interpretación de datos genómicos, perfilado tumoral, variación de línea germinal, ADN libre en células e integración con datos de qPCR o proteómicos, computación basada en la nube (AWS, GCP), contenerización (Docker/Singularity) y control de versiones (Git) para flujos de trabajo escalables y reproducibles.
Competencia en Python, R y scripting de shell.
Experiencia en el uso de motores de flujo de trabajo (por ejemplo, Nextflow, Snakemake, WDL/Cromwell).
Conocimientos sobre marcos regulatorios (CLIA, CAP, GLP) y procesos de validación de ensayos para apoyar estudios clínicos o dirigidos a clientes.
Ubicación laboral: Deerfield Beach, FL.
Horario: 40 horas por semana, de lunes a viernes.
Para postularse, visite: https://www.frontagelab.com/about/careers/